Ferramenta gratuita facilita análise de dados genéticos no Brasil
Foto: Agência Fapesp / Poder 360
por Redação Rondônia Hoje
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Pesquisadores da Universidade Estadual de Campinas (Unicamp) e colaboradores desenvolveram uma ferramenta online gratuita chamada CellForgeR, que visa facilitar a análise de dados de expressão gênica em células individuais. Este software, o primeiro do tipo criado no Brasil, promete ampliar a capacidade de pesquisa nas áreas de saúde e biologia, permitindo que pesquisadores sem experiência em programação realizem análises complexas.
A ferramenta utiliza a metodologia de sequenciamento de RNA de célula única (single-cell RNA-seq), que transforma a abordagem tradicional de análise de tecidos. Em vez de estudar um grupo de células, a técnica permite a identificação da expressão gênica em cada célula individualmente, oferecendo um nível de detalhes inédito. Marcelo Mori, professor do Instituto de Biologia da Unicamp e um dos desenvolvedores da plataforma, destaca que essa metodologia possibilitou descobertas significativas, como a complexidade dos macrófagos, que antes eram classificados de maneira simplificada, e a diversidade dos adipócitos.
De acordo com Mori, a tecnologia tem um impacto comparável ao que o microscópio eletrônico trouxe para a biologia, pois permite uma visualização mais detalhada das amostras biológicas e altera as maneiras de investigação e formulação de hipóteses. A interface do CellForgeR é intuitiva, permitindo que os usuários selecionem parâmetros, tipos celulares e genes de interesse por meio de menus e botões, sem a necessidade de programação.
Diogo de Moraes, pesquisador da Universidade Estadual Paulista e um dos criadores do CellForgeR, explica que trabalhar com grandes volumes de dados exige conhecimento em bioinformática e acesso a computadores potentes. Ele relata que, durante sua passagem pela Harvard Medical School, sentiu a necessidade de desenvolver uma plataforma acessível no Brasil, levando à criação do CellForgeR em colaboração com especialistas de outras instituições, como Unesp e Universidade de São Paulo.
A plataforma opera em um data center da Unicamp, o Cluster Científico do Instituto de Biologia, o que elimina a necessidade de instalação no computador do usuário. A ferramenta visa simplificar perguntas que antes demandavam várias etapas de programação e um computador de alto desempenho, permitindo que pesquisadores explorem dados de forma rápida e eficiente.
O CellForgeR faz parte de uma estratégia mais ampla do grupo de pesquisadores, que inclui a capacitação de recursos humanos para pesquisa. Mori afirma que o objetivo é capacitar cientistas no uso de técnicas laboratoriais e na manipulação de dados de sequenciamento de células únicas, enfrentando as barreiras que dificultam a pesquisa. Além disso, os laboratórios envolvidos planejam oferecer treinamentos para interessados em se aprofundar na análise de dados de single-cell RNA-seq, ampliando assim o acesso a essas tecnologias.
Com informações de Poder 360.
